1、Gromacs官网：gromacs.org

2、Gromacs中文教程：jerkwin.github.io‍   【重磅推荐】‍

3、‍Gromacs英文教程：mdtutorials.com/gmx

4、计算化学公社（思想家公社）：bbs.keinsci.com/forum.php‍     sobereva.com‍   【重磅推荐】‍

5、ATB：atb.uq.edu.au/index.py‍

6、VMD：ks.uiuc.edu/Research/vmd‍

7、Pymol：pymol.org/2‍

8、Molview：molview.org‍

9、gmxtop：jerkwin.github.io/prog/gmxtop.html‍

10、Pubchem：pubchem.ncbi.nlm.nih.gov‍

11、PDB：rcsb.org‍

12、Bio2byte：bio2byte.be/acpype‍

13、爱化学：ichemistry.cn/structure.asp‍

14、OSRA: cactus.nci.nih.gov/cgi-bin/osra/index.cgi‍

15、使用VMD中的Tachyon渲染出透明逼真的水盒子效果

16、PRODRG：davapc1.bioch.dundee.ac.uk/cgi-bin/prodrg/submit.html‍

17、Polypargen（高分子）：polypargen.com/upload_file.php‍

18、Marvinjs：marvinjs-demo.chemaxon.com/latest‍

19、Ligpargen：zarbi.chem.yale.edu/ligpargen/index.html‍

20、哔哩哔哩（bilibili）：bilibili.com‍   【重磅推荐】

21、微信公众号：模拟之家、分子模拟之道、分子动力学、AIDD Pro、叮当科研、殷斌科技、药研小木子（需自行关注）【重磅推荐】